Un niño de 12 años se encuentra con una mujer inquietante e hiperactiva que lleva siempre una guitarra baja. En lugar de ser un simple instrumento musical, la guitarra también actúa como una sierra circular, que luego utiliza para cortar las extrañas criaturas que crecen en la cabeza del joven protagonista.
Muchas cosas suceden al mismo tiempo en esta aventura acalorada que es FLCL, destacando el buen rock alternativo de los años 2000 de la banda japonesa The Pillows. Esta es sin duda una gran opción para cualquier persona que desee sumergirse en un anime fuera de lo común.